जिससे उन्हें कर्मचारियों Employees को छोड़ने और अपनी परियोजनाओं को काफी कम करने के लिए मजबूर होना पड़ा है - अगर वे किसी तरह जीवित रहने में कामयाब रहे। हालाँकि एनपीओ के लिए कोई उचित डेटाबेस मौजूद नहीं है, लेकिन 2012 में एक गणना के अनुसार 2008 तक 31.7 लाख पंजीकृत एनपीओ थे, जबकि आयकर विभाग ने 2022 में 2.52 लाख की गिनती दी। इस महीने, एफसीआरए के आंकड़े 15,958 सक्रिय संघों को दिखाते हैं, जिनमें से 34,000 से अधिक या तो समाप्त हो चुके हैं या रद्द कर दिए गए हैं। इन सभी संस्थाओं को 2020 में अपने पंजीकरण को फिर से मान्य करना पड़ा।
सरकार ने माल और सेवा कर लगाने के साथ ही आराम नहीं किया, बल्कि निर्देश दिया कि
प्रशासनिक खर्चों के लिए 20% से अधिक विदेशी धन की अनुमति नहीं दी जाएगी और भारतीय स्टेट बैंक की एक शाखा में बैंक खाते अनिवार्य होंगे। 2023 में, नए संशोधनों में छोटी संस्थाओं को उप-अनुदान देना बंद करना शामिल था। इसने कई जमीनी स्तर के एनजीओ को खत्म कर दिया, जो फंड के लिए बड़े संगठनों पर निर्भर थे। फिर भी छोटे एनजीओ ने जमीन के करीब परियोजनाओं को अंजाम दिया, जहाँ बड़े एनजीओ नहीं पहुँच सकते थे। एनजीओ क्षेत्र में कार्यों का वितरण अचानक बाधित हो गया। सरकार के निषेधात्मक दृष्टिकोण, जिसमें कुछ छापे भी शामिल थे, ने भारतीय दानदाताओं को ठंडा कर दिया, जबकि कॉर्पोरेट सामाजिक जिम्मेदारी नियमों ने एनजीओ को उनके समर्थन को सीमित कर दिया। गृह मंत्री ने 2020 में संस्थानों के साथ सरकार के मुद्दे को स्पष्ट किया, जब उन्होंने कहा कि नए नियम यह सुनिश्चित करेंगे कि कोई भी संगठन राष्ट्र-विरोधी गतिविधि, धार्मिक रूपांतरण, विकास परियोजनाओं के राजनीतिक विरोध और सरकारी नीतियों के विरोध में शामिल न हो।
घटनाओं ने दिखाया है कि पहले दो कृत्यों के लिए किसी भी इकाई या व्यक्ति पर आरोप लगाना मुश्किल नहीं है, जबकि अन्य दो सुझाव देते हैं कि सरकार की आलोचना निषिद्ध है। फिर भी नीतियों या उनके कार्यान्वयन द्वारा छोड़े गए दोषों को दूर करने में एनजीओ सबसे प्रभावी हैं। शायद यही कारण है कि अधिकार-आधारित दृष्टिकोण और वकालत को एक कठिन झटका लगा है; जो लोग सबसे अधिक पीड़ित हैं वे अल्पसंख्यक समूह, महिलाएँ और लड़कियाँ हैं जो अपराध का लक्ष्य हैं, विकलांग व्यक्ति, LGBTQA+ और इसी तरह के अन्य वर्ग। FCRA संशोधन सरकार की सभी क्षेत्रों पर पूर्ण नियंत्रण की इच्छा और अंतर के प्रति असहिष्णुता की धारणा को पुष्ट करते हैं। लेकिन पीड़ितों की सूची बताती है कि वंचित भी अत्यधिक प्राथमिकता नहीं हैं।