Kyunki Saas Bhi Kabhi Bahu Thi 2: क्योंकि सास भी कभी बहू थी 2' की कहानी में 6 साल का बड़ा लीप आया है, और इसके साथ ही सबकी ज़िंदगी पूरी तरह बदल गई है। रिश्ते उलझ गए हैं, प्यार अधूरा रह गया है, और हर किरदार अपनी-अपनी लड़ाइयाँ लड़ रहा है। लीप के बाद सबसे बड़ा बदलाव तुलसी और मिहिर की ज़िंदगी में देखने को मिलता है। तुलसी सब कुछ छोड़कर अचानक गायब हो गई है, जबकि मिहिर अपनी ज़िंदगी में आगे बढ़ने की कोशिश कर रहा है, लेकिन वह तुलसी के बिना कुछ नहीं कर पा रहा है।
लीप के बाद, तुलसी ने कुछ लड़कियों की मदद से अपना खुद का बिज़नेस शुरू किया है। वृंदा और अंगद भी उसका साथ दे रहे हैं। अच्छी कमाई के बावजूद, उसकी ज़िंदगी में एक खालीपन है। दूसरी ओर, नैना पिछले छह सालों से मिहिर के साथ उसकी पत्नी बनकर रह रही है। लेकिन लोग उसे ताना मारते हैं और बार-बार सवाल करते हैं कि इतने साल साथ रहने के बाद भी उन्होंने शादी क्यों नहीं की, जिससे नैना टूटा हुआ महसूस करती है। तुलसी ने मिहिर को बिना तलाक दिए छोड़ दिया था। इसी वजह से मिहिर नैना से शादी नहीं कर सकता।
समय के साथ, नैना का गुस्सा मिहिर पर फूट पड़ता है। उसे धोखा महसूस होने लगता है। नैना से शादी करने के लिए, मिहिर तुलसी को ढूंढने का फैसला करता है। लेकिन मिहिर तुलसी तक नहीं पहुँच पाता क्योंकि उसे लगता है जैसे तुलसी दुनिया से गायब हो गई है। करण और नंदिनी की शो में वापसी से पुराने राज़ सामने आएंगे। अपने भाइयों से झगड़े के बाद, मिहिर घर छोड़कर अलग रहने लगेगा, और वीरानी बिज़नेस भी उसके हाथों से निकल जाएगा। इस बीच, गायत्री शांति निकेतन पर कब्ज़ा करने की तैयारी कर रही है। दूसरी ओर, रणविजय की वजह से परी की ज़िंदगी आँसुओं से भर जाएगी।