नागरिक उड्डयन मंत्रालय को वेब चेक-इन औपचारिकताओं को पूरा करने के लिए एयरलाइनों से अतिरिक्त शुल्क लेने की शिकायतें मिल रही हैं। नागरिक उड्डयन राज्य मंत्री जनरल वीके सिंह (सेवानिवृत्त) ने एक प्रश्न का लिखित उत्तर देते हुए कहा कि अनुसूचित घरेलू एयरलाइंस वेब चेक-इन औपचारिकताओं को पूरा करने के लिए कोई शुल्क नहीं ले रही हैं। उनसे पूछा गया कि क्या देश में ज्यादातर एयरलाइन कंपनियां यात्रा से पहले ऑनलाइन चेक-इन के नाम पर यात्रियों को ज्यादातर सीटें भुगतान के आधार पर दे रही हैं। सिंह ने जवाब दिया कि नागरिक उड्डयन महानिदेशालय (डीजीसीए) ने 2021 का एयर ट्रांसपोर्ट सर्कुलर (एटीसी) -01 जारी किया है,
जिसका शीर्षक है, "अनुसूचित एयरलाइनों द्वारा सेवाओं और शुल्क का अनबंडल" जिसके अनुसार, अधिमान्य बैठने जैसी कुछ सेवाओं की अनुमति दी गई है। यात्रियों से अलग और अलग से चार्ज किया गया। ऐसी असंबद्ध सेवाएं एयरलाइनों द्वारा "ऑप्ट-इन" आधार पर प्रदान की जाती हैं और प्रकृति में अनिवार्य नहीं हैं। यह सवाल पुडुचेरी से बीजेपी सांसद एस सेल्वगनबथी ने उठाया था। उन्होंने आगे पूछा कि क्या सरकार द्वारा एयरलाइन कंपनियों को सीटों की बिक्री और आवंटन को विनियमित करने के लिए कोई दिशानिर्देश जारी किए गए हैं।