NCERT ने अपनी 12वीं कक्षा की पाठ्यपुस्तकों से 2002 के गुजरात दंगों, आपातकाल, शीत युद्ध, नक्सली आंदोलन और मुगल अदालतों के बारे में कुछ अंश हटा दिए हैं। राष्ट्रीय शैक्षिक अनुसंधान और प्रशिक्षण परिषद (एनसीईआरटी) ने पाठ्यक्रम से उन हिस्सों को हटाने के कारणों के रूप में 'अतिव्यापी' (overlapping)और 'अप्रासंगिक' (irrelevant) का हवाला दिया है। इनमें से कई बदलावों की घोषणा इस साल की शुरुआत में की गई थी, जब केंद्रीय माध्यमिक शिक्षा बोर्ड (सीबीएसई) ने अप्रैल में अपने पाठ्यक्रम को युक्तिसंगत (rationalised) बनाया था।
CBSE के तहत आने वाले स्कूलों के अलावा, कुछ राज्य बोर्ड भी NCERT की पाठ्यपुस्तकों का उपयोग करते हैं। इन परिवर्तनों को सूचीबद्ध करते हुए, NCERT ने एक नोट में कहा, 'पाठ्यपुस्तकों की सामग्री को विभिन्न कारणों से युक्तिसंगत बनाया गया है, जिसमें एक ही कक्षा में अन्य विषय क्षेत्रों में समान सामग्री के साथ ओवरलैपिंग, निम्न या उच्च कक्षाओं में एक ही विषय में समान सामग्री शामिल है। इस नोट में आगे यह भी कहा गया है कि कठिनाई स्तर, सामग्री जो शिक्षकों के अधिक हस्तक्षेप के बिना छात्रों के लिए आसानी से सुलभ है और स्व-शिक्षण या सहकर्मी-शिक्षण द्वारा सीखी जा सकती है और सामग्री जो वर्तमान संदर्भ में अप्रासंगिक है, उसे हटा दिया गया है।
कक्षा 12 की राजनीति विज्ञान की पाठ्यपुस्तक में, 'गुजरात दंगे' विषय के पन्नों को 'भारतीय राजनीति में हालिया विकास' शीर्षक वाले अध्याय से बाहर रखा जाएगा। 2002 की हिंसा पर राष्ट्रीय मानवाधिकार आयोग की रिपोर्ट और तत्कालीन प्रधान मंत्री अटल बिहार वाजपेयी द्वारा 'राज धर्म' टिप्पणी का उल्लेख पाठ्यपुस्तक से हटा दिया गया है। यही नहीं इसके अलावा, इतिहास की पाठ्यपुस्तक में मुगल दरबारों पर अध्याय, दलित आंदोलन पर एक कविता और शीत युद्ध पर एक अध्याय, राजनीति विज्ञान की पाठ्यपुस्तक से बाहर रखा गया है।
वहीं कक्षा 10 में, बहिष्कृत अध्यायों में पाठ्यपुस्तक 'लोकतांत्रिक राजनीति II' के 'धर्म, सांप्रदायिकता और राजनीति - सांप्रदायिकता, धर्मनिरपेक्ष राज्य' खंड में कवि फैज अहमद फैज के छंद शामिल थे। इसके साथ ही 'लोकतंत्र और विविधता', 'लोकप्रिय संघर्ष और आंदोलन' और 'लोकतंत्र की चुनौतियां' शीर्षक वाले अध्याय हटा दिए गए हैं, जबकि कक्षा सात और आठ की सामाजिक विज्ञान की पाठ्यपुस्तक में दलित लेखक ओमप्रकाश वाल्मीकि के संदर्भ हटा दिए गए थे। कक्षा सात की पाठ्यपुस्तक 'अवर पास्ट्स-2' में 'सम्राट: प्रमुख अभियान और घटनाएं' विषय को हटा दिया गया है।